2016年是学校建校60周年，为配合开展校庆相关活动，经学校2016年第1次党委常委会审定，现公布校庆LOGO。

校庆LOGO释义：

60年为一甲子，数字6缘起阴阳太极，升腾舒展，寓意学校60年的蓬勃发展。数字0幻变为半圆的“逗号”，与数字6相互呼应，寓意上海中医药大学的发展源远流长。整体造型具有“爱心”的轮廓，寓意中医药事业呵护百姓健康，造福人类。苍劲的书法体笔触具有浓郁的中国传统文化意蕴，整体造型厚重古朴又充满活力。